宇宙世紀0092――〝忘れられたスペースコロニー〟ムーン・ムーンに謎のモビルスーツの頭部が衝突したことから、すべては始まった。衝突の影響でコロニーに不具合が生じ、ユッタ・カーシムらは助けを求めるべく外の世界に乗り出す。しかしそこは、増えすぎた人間を宇宙に追い出して安穏とする地球連邦政府と、連邦を倒して宇宙移民者の自治独立を果たさんとするジオン公国残党――ネオ・ジオンとの抗争が続く混沌とした世界であった。不用意にネオ・ジオンの人々と接触したことで、ムーン・ムーンに戦争を持ち込む不幸を招いてしまうユッタたち。連邦軍の追撃のみならず、ネオ・ジオンの内部抗争にも巻き込まれ、ムーン・ムーンは壊滅の危機にさらされる。その時、ユッタの悲憤に感応するように謎のモビルスーツが起動。三日月のように見える武器を用い、コロニーに攻め入った敵を撃破した機体は、数多の戦乱で伝説的な活躍を示した〝ガンダム〟そのものに見えた。